собрал схему, работает, но чую что то не надолго такая развязка потянет, хотелось бы узнать ваше мнение по развязке и защите, если какие то недочеты готов выслушать.
значит справа посылаются от внешнего источника импульсные сигналы, питание общее, на выходе они дублируются слева,слева они должны приемник сигнала опускать в ноль, когда там единичка(5в).

Я, честно говоря, ничего не понял. Что за защита? Чего? Какой алгоритм? Зачем контроллер?

алгоритм простой, приходит 5в, контроллер обрабатывает и переключается на последний входящий сигнал и выдает импульсы с входящего сигнала на выход где слева, хочу защитить микросхему от каких либо паразитных источников питания со стороны входа и выхода

Честно опять не всче понятно зачем такое надо, что на входе, что на выходе. Можно так входы защитить, как на рисунке. Можно опторазвязку поставить. Отчасти вы входы резисторами защитили. Это не полноценная защита, но хоть что то. Зная что на входе и что на выходе будет проще дать совет. А то можно нагородить много всего, но нужно ли оно будет.